Le due tecniche differiscono in base alla metodologia di produzione delle immagini radiologiche: la risonanza utilizza campi magnetici, la TAC le radiazioni ionizzanti.
L'angiorisonanza è superiore all'angioTAC per la valutazione dei vasi del distretto encefalico, mentre la angioTAC è superiore all'angiorisonanza per il distretto del collo e toracico.
Per gli altri distretti (addome,arti)le due metodiche sono equivalenti.