La doxiciclina è un antibiotico a largo spettro, ma non copre tutte le specie batteriche. Se i suoi disturbi fossero l'espressione di una prostatite, la terapia antibiotica dovrebbe essere proseguita per alcune settimane, ma occorrerebbe ricercare anche possibili infezioni da germi meno comuni (Clamydia, Ureaplasma).