Vi possono essere numerose cause responsabili di tale alterazione. Esse vanno cercate tra i fattori che sono in grado di determinare un danno epatico. Infatti il test ALT è spesso associato ad una malattia epatica. Pertanto va ricercata assunzione di alcolici o di farmaci epatotossici; la ricerca di malattie epatiche da accumulo di metalli pesanti (ferro e rame); le malattie autoimmuni; la epatosteatosi. In alcuni casi può essere utile effettuare una biopsia epatica. Quest’ultima può fornire elementi utili per valutare l’entità del danno epatico ed indizi sulle possibili cause che lo hanno determinato.