La malattia da reflusso gastro-esofageo non ha dirette conseguenze sul sistema cardiovascolare. Essa tuttavia può fungere da spina irritativa per il cuore determinando la comparsa di aritmie (extrasistoli o tachicardie sopraventricolari) e può provocare, a volte, una sintomatologia dolorosa toracica che può essere scambiata (in quanto talora molto simile) con una sintomatologia di tipo anginoso.